Európska komisia začala tzv. nový biogeografický proces, t. j. neformálny proces s členskými štátmi EÚ zameraný na výmenu informácií a skúseností, dobrých postupov a zlepšenie cezhraničnej spolupráce pre manažment území sústavy Natura 2000. Proces prebieha postupne v rámci všetkých 9 biogeografických regiónov. Začína sústreďovaním údajov k vybraným témam, ktoré sú následne prezentované na seminároch pre jednotlivé biogeografické regióny. Slovenskej republiky sa týka alpský seminár (plánovaný v októbri 2013 v Tyrolsku) a panónsky seminár (plánovaný na jar 2015). Príprava biogeografického procesu pre alpskú oblasť začala v r. 2012. Európska komisia zverejnila podrobné zhodnotenie („pre-scoping“ - prípravný dokument), a spoločne s členskými štátmi vybrala 22 typov biotopov európskeho významu a v nich zastúpené druhy, na ktoré bude biogeografický proces zameraný. Patria sme „riečne, jazerné“ (6), trávnaté (6), iné mokraďové (4) a lesné (6)“; biotopy a na ne viazané vybrané druhy. 20 typov biotopov sa prirodzene vyskytuje aj na území Slovenska a len jeden z nich je v priaznivom stave. Do 28.2.2013 je možné pripomienkovať tzv. „background dokument“ a zaslať relevantné príklady – pre obe boli pripravené formuláre. Do pripomienkovania resp. sústreďovania údajov môže byť zapojená verejnosť, rovnako sa očakáva aj širšie spektrum účastníkov na samotnom biogeografickom seminári. Partnerom Európskej komisie na národnej úrovni je sekcia ochrany prírody a tvorby krajiny MŽP SR spoločne so Štátnou ochranou prírody SR.

Dňa 26. januára 2013 boli v Úradnom vestníku Európskej únie zverejnené vykonávacie rozhodnutie Komisie 2013/22/EÚ zo 16. novembra 2012, ktorým sa prijíma šiesty aktualizovaný zoznam lokalít európskeho významu v alpskom biogeografickom regióne a Vykonávacie rozhodnutie Komisie 2013/24/EÚ zo 16. novembra 2012, ktorým sa prijíma šiesty aktualizovaný zoznam lokalít európskeho významu v panónskom biogeografickom regióne. Rozhodnutia obsahujú aj národný zoznam 493 území európskeho významu (aktualizovaný v súlade s uznesením vlády Slovenskej republiky č. 577/2011). Doplnením nových lokalít do EU databázy území Natura 2000 tak Slovenská republika zmenšila počet biotopov a druhov európskeho významu, pre ktoré je ešte potrebné vymedziť nové lokality. Nedostatočne zastúpené biotopy a druhy európskeho významu sú zverejnené TU. Podľa údajov Európskej komisie bolo doplnených 166 nových lokalít s výmerou 18 800 km2, z toho 17 000 km2 morských. Sústava Natura 2000 v súčasnosti pokrýva takmer 18 % “pevninskej výmery” EÚ a 145 000 km2 jej morí.

Pod č. 35 vyšlo v novembri 2012 ďalšie číslo periodika Science for Environmental Policy zamerané na sústavu Natura 2000. Na spolu 16 stranách je sústredený prehľad aktuálne riešených otázok, akou je ekonomické oceňovanie prínosov Natura 2000, koncept „divočiny“, rozpracovanie EU cieľa na zlepšenie stavu biotopov a druhov európskeho významu, ekoturizmus, súvislosti so zmenou klímy a i. Články obsahujú aj odkazy na publikácie a ďalšie zdroje informácií.

S účinnosťou od 1. januára 2013 vstupuje do platnosti vyhláška MŽP SR, ktorou sa vyhlasuje Chránené vtáčie územie Levočské vrchy. Ide o posledné vtáčie územie, ktoré mala Slovenská republika vyhlásiť v zmysle smernice EÚ o vtákoch.

V dňoch 4. a 5. októbra 2012 v Bruseli zasadal Výbor pre biotopy a výbor ORNIS, na ktorých delegáti členských štátov EÚ schválili úpravu interpretačného manuálu biotopov EÚ (aktualizovaný v súvislosti s očakávaným pristúpením Chorvátska do EÚ) a EU usmernenie k uplatňovaniu článku 9 smernice o vtákoch vo vzťahu ku kormoránovi veľkému. Európska komisia informovala o vytvorení komunikačnej platformy ku kormoránovi, o príprave plánu eliminácie vtáčej kriminality, plánu pre ochranu morského vtáctva pred náhodným odchytom pri rybolove, o pokroku v novom biogeografickom procese s členskými štátmi a pri budovaní sústavy Natura 2000; o ďalších krokoch k zefektívneniu prípravy a využitia plánov záchrany pre druhy vtáctva, plánov záchrany pre ostatné živočíchy a prezentovala výsledky projektu pre ochranu vtáctva. Kľúčovými úlohami členských štátov na najbližšie obdobie je príprava prioritného akčného plánu financovania Natura 2000 na roky 2014 -2020 a dopracovanie správy podľa článku 17 smernice o biotopoch a podľa článku 12 smernice o ochrane vtáctva. Obe správy sa vzťahujú na obdobie do r. 2012 a majú byť predložené Európskej komisii v roku 2013.
Dokumenty z Výboru pre biotopy
Dokumenty z ORNIS

Európska komisia schválila nový (podrobnejší) formát prekladania správy o kompenzačných opatreniach [doc, en], slovenská verzia - pozri [doc]. Ide o povinnosť členských štátov vyplývajúcu z článku 6.4 smernice o biotopoch. Kompenzačné opatrenie sú krajným riešením, keď už boli vykonané všetky kroky primeraného posúdenia možných vplyvov plánu alebo projektu na územia sústavy Natura 2000, t. j. na prípady, keď z posúdenia vyplynie, že plán alebo projekt bude mať nepriaznivý vplyv na územie sústavy Natura 2000 a na celkovú súvislosť Natura 2000, ale ho potrebné realizovať vo vyššom verejnom záujme. Kompenzačné opatrenia majú primerane „nahradiť“ stratu prvkov a funkcií a podľa názoru Európskej komisie by mali byť vykonané skôr, ako dôjde k realizácii plánu alebo projektu. Správu predkladajú členské štáty Európskej komisii buď pre informáciu alebo na stanovisko (to v prípade výskytu tzv. prioritných biotopov alebo prioritných druhov európskeho významu).

Krajský úrad životného prostredia v Prešove podľa §50 zákona č. 543/2002 Z. z. o ochrane prírody a krajiny v znení neskorších predpisov oznámil formou verejnej vyhlášky dotknutým obciam v bývalom Vojenskom obvode Javorina zámer na vyhlásenie Chráneného vtáčieho územia Levočské vrchy. Ide o posledné územie z národného zoznamu navrhovaných chránených vtáčích území, ktoré Slovenská republika zatiaľ ešte nevyhlásila. Vyhlasuje sa za účelom zabezpečenia priaznivého stavu biotopov 19 druhov vtákov európskeho významu, vrátane bociana čierneho, ďatľa trojprstého, orla skalného a výra skalného. Oznámenie zámeru a všetky jeho prílohy sú prístupne na stránke KÚ ŽP Prešov.

Jej cieľom je prispievať k ochrane biologickej diverzity prostredníctvom ochrany prirodzených typov biotopov a voľne žijúcich rastlín a živočíchov. Poskytuje právnu ochranu vyše 200 typom lesných, lúčnych, vodných a skalných biotopov a viac ako tisíc druhom európskeho významu. Taktiež právne chráni územia európskeho významu, ktoré členské štáty vymedzili na ploche vyše 750 000 km2. Reč je o európskej smernici o biotopoch, od ktorej prijatia prešlo práve dnes, 21. mája 2012, 20 rokov. Na stránke Európskej komisie je zverejnená tlačová správa k 20. výročiu smernice o biotopoch a finančného nástroja LIFE, nová publikácia o prínose smernice o biotopoch a o dobrých príkladoch z jednotlivých členských štátov, ako aj ďalšie informácie o ochrane prírody v Európskej únii.